1、功能设计的单一问题。应用配电自动化系统，提高供电可靠率，似乎成了功能设计的传统思路。但据电力可靠性中心简报数据表明，现阶段影响供电可靠性的主要因素不是配电网的故障停电，75%以上的问题出于按照固有传统周期例检方式，导致的人为预安排停电。只有在提高管理水平，当故障停电时间等于或大于预安排停电时，才会体现出这一功能的作用。

2、电能质量监测装置配电自动化由单纯的配电监控，与数据采集系统加配电自动化转向具有DA、配电管理系统、地理信息系统等较完整的配电自动化实时及供电企业管理系统，配电主站系统也由借用调度主站系统，逐步转向选择面向配电自动化应用的配电自动化主站系统。

3、设备选择中的盲目求新。缺乏通盘考虑，忽视自身基础，盲目在局部设备上求新求好，结果新设备上马、老设备犯卡，无法取得整体优化的效果。系统结构设计中的顾此失彼。在功能设计中缺乏统筹兼顾，出现控制端与主站功能不匹配、通信通道容量不足、一次网架设备不适应，把配电自动化系统装在陈旧的配电网架上，其效果难以实现。

4、管理体制与管理机制中的传统弊端。配电自动化系统主要覆盖生产、营销两大专业，如果还强调垂直职能专业管理，没有条块结合分工协作的保证措施，再好的系统也举步维艰。同时在系统功能设计中，还存在传统管理机制中的重系统、轻客户；重技术、轻管理；重形式、轻实效的思维定式。

5、GIS还是孤立的静态设备管理系统，而不是动态的实时GIS，将SCADA和地理信息统一起来。配电自动化系统功能规范行业标准虽然已经颁布，但要解决各地配电自动化的不规范问题，仍需要一个过程。